debianのntpdateも結構いろいろ変化してて、ときたま入れ直すと挙動が違ってて。
/etc/init.d/に有ったかと思ったんだが無いこともあるので、めんどくさいからcrontabに書く(笑)
参照先のntp鯖はpool.ntp.orgとかが指定されてたはずにゃんだが、引けにゃいこともあったので
ntpdate 131.107.1.10 207.46.130.100 192.43.244.18 pool.ntp.org
みたいにとりあえずたくさん書いておく(笑)
IP直指定のところは後日検討